ACE/FITTED/IMPACTS: Un nouvel algorithme d’optimisation énergétique (LBFGS) a été mis en service, ce qui a permis d’augmenter considérablement la vitesse (environ 2 à 3 fois).

SELECT:

• Les fingerprints peuvent être calculés à l’avance et stockés lors de la comparaison des bibliothèques.
• La diversité des bibliothèques peut maintenant être calculée.
• Des clusters entiers peuvent être imprimés ou un nombre donné de molécules par cluster.
• Pour permettre la création de clusters de taille similaire, des doublons peuvent être ajoutés aux petits clusters.
• Les informations peuvent être imprimées au format CSV pour les molécules les plus similaires (analogues) ou les plus dissimilaires.

CONVERT:

• Le nombre maximal de sites protonés peut être défini.
• Lors de la conversion de sdf en mol2 (ajout d’hydrogènes,…), les molécules peuvent être centrées dans l’espace des coordonnées.

FITTED:

• Les interactions par paire entre les ligands et les résidus des protéines peuvent être imprimées.
• Les propriétés (descripteurs et interactions) peuvent être imprimées au format CSV.
• Nouvelle implémentation pour la définition des cycles.
• Nouvelle implémentation pour la définition des molécules de référence pour les calculs RMSD (par exemple, détection de la symétrie C2, symétrie par rotation,…).
• Les résultats sont désormais présentés dans un fichier html dynamique mis à jour en temps réel.

SMART:

• En sdf 2D, les hydrogènes (ou seulement les hydrogènes polaires) peuvent être conservés ou supprimés.

CONSTRUCTS:

• Lors de la construction d’un modèle à partir de réactifs et de produits, il est désormais possible d’ajouter des liaisons ou des liaisons factices et de supprimer des liaisons.
• Amélioration de la superposition et de l’assemblage des structures TS.

REACT2D/FINDERS:

• Le codage des réactions à partir des schémas et la correspondance des schémas avec les réactifs ont été considérablement révisés/améliorés.
• Le nettoyage des structures en 2D a été réécrit.

Améliorations générales :

• Interface utilisateur : Mise à jour et ajout de nouvelles fonctions.
• Utilitaires : Mise à jour de la fonction de conversion de SMILES en sdf.
• Kit d’installation : Installateur Windows avec identification et installation automatique des bibliothèques manquantes et ajout d’un raccourci sur le bureau.
• Demande de licence et installation plus faciles.
• Liste des paramètres : Mise à jour.