En tant que CRO (organisme de recherche sous contrat) spécialisé dans la chimie et axé sur l'espace chimique chiralement pur, Liverpool ChiroChem, LCC, est fier de sa compréhension de la synthèse asymétrique. Pour répondre aux besoins en matière de découverte de médicaments, de l'identification des hits à l'optimisation des lead, LCC nous a demandé de l'aider à développer ses bibliothèques virtuelles afin de les partager avec ses clients biotechnologiques et pharmaceutiques dans le monde entier.

Compte tenu de notre expertise dans le domaine, nous avons travaillé en étroite collaboration avec les scientifiques de LCC pour établir les scénarios couvrant six réactions chimiques qui seraient réalisées en interne. Certaines de ces réactions étaient simples (par exemple, les couplages d'amides), tandis que d'autres nécessitaient une manipulation particulière. Par exemple (voir figure ci-dessous) :

1. Différents stéréoisomères pouvant être générés au cours d'une réaction (par exemple, une N-alkylation par amination réductrice)
2. Certains synthons, comme la diamine ci-dessous, contenaient plus d'une anse synthétique. Nous avons virtuellement marqué l'atome réactif, facilitant ainsi les transformations appropriées et évitant les produits secondaires indésirables.

Nous avons utilisé notre plateforme propriétaire, principalement REACT2D, pour exécuter virtuellement les six réactions et générer 1,3 million de produits uniques tout en conservant des informations stéréochimiques cruciales. Le synthon, le bloc de construction commercial et la voie de réaction sont codés pour chaque produit à l'intérieur d'un identifiant unique, ce qui permet de déterminer facilement comment fabriquer l'une ou l'autre de ces molécules en laboratoire.

La bibliothèque virtuelle résultante a été filtrée pour détecter les propriétés similaires à celles des médicaments, les groupes réactifs indésirables et les doublons. Les distributions des principales propriétés physico-chimiques ont ensuite été générées avec Forecaster. Nous avons également étudié les similitudes avec l'espace des brevets SureChEMBL et fourni des sous-ensembles regroupés pour une navigation plus rapide.

L'équipe d'LCC assure désormais la maintenance de la bibliothèque et sa version actuelle est disponible à l'adresse : www.liverpoolchirochem.com/3discovery-virtual-library.

The physical results can now be synthesized in LCC's parallel synthesis laboratory in the UK.